第二條 鎭守府ハ出師ノ準備、防禦ノ計畫、海軍區ノ警備竝所轄諸部ノ事務ヲ監督スル所トス
第四條 司令長官ハ
天皇ニ直隸シ麾下ノ艦隊艦船部團隊ヲ統率シ所屬各部ヲ監督シ府務ヲ總理ス
司令長官ハ軍政人事ニ關シテハ海軍大臣ノ指揮ヲ承ケ出師準備防禦計畫ニ關シテハ海軍軍令部長ノ區處ヲ承ク
第五條 司令長官ハ麾下ノ軍紀風紀及敎育訓練ヲ統監ス
第六條 司令長官ハ麾下ノ艦隊、艇隊若ハ艦船ヲ所管海軍區及鄰區內ニ派遣シ又軍隊ヲ所管海軍區內ニ派遣スルコトヲ得
第七條 司令長官ハ其ノ軍港內ニ在ル他ノ所管ノ艦船ヲ指揮スルコトヲ得但シ他ノ司令長官司令官現在スルトキ其ノ麾下艦船ニ對シテハ此ノ限ニアラス
第八條 司令長官ハ地方長官ヨリ地方ノ安寧ヲ維持スル爲兵力ヲ請求スルトキ事急ナレハ直ニ之ニ應スルコトヲ得其ノ事地方長官ノ請求ヲ待ツノ遑無キトキハ便宜兵力ヲ用フルコトヲ得此ノ場合ニ當リテハ事後速ニ海軍大臣ニ報吿スヘシ
第九條 司令長官ハ疾疫其ノ他緊急ノ場合ニ方リ一時麾下ノ兵員ヲ移轉セシムルヲ必要トスルトキハ之ヲ處分シテ後海軍大臣ニ報吿スヘシ
第十條 司令長官ハ麾下ノ雜役船舟ニ乘員ヲ要スルトキハ麾下人員ニ臨時乘組ヲ命スルコトヲ得
第十一條 司令長官ハ麾下ノ候補生及准士官ヲ麾下艦船團其ノ他各部ニ轉乘若ハ轉勤セシムルコトヲ得
第十二條 司令長官ハ麾下ノ下士卒ヲ所屬艦船團其ノ他各部ニ配付ス
第十三條 司令長官ハ軍機保護ノ爲ニ所在憲兵ヲ指揮スルコトヲ得
第十四條 司令長官ハ麾下ノ職員缺員中若ハ事故アリテ其ノ職務ヲ執ルコト能ハサルトキハ他ノ麾下職員ヲシテ其ノ職務ヲ代理セシムルコトヲ得
第十五條 司令長官缺員中若ハ事故アリテ其ノ職務ヲ執ルコト能ハサルトキハ所在麾下首席將校其ノ職務ヲ代理ス
第十七條 參謀長ハ司令長官ヲ佐ケ幕僚ノ事務ヲ統ヘ府務ヲ整理ス
第十九條 副官ハ參謀長ノ命ヲ承ケ庶務及准士官以上竝所屬文官ノ人事ヲ掌ル
第二十條 鎭守府ニ望樓監督官ヲ置キ參謀長ノ命ヲ承ケ海軍望樓ニ關スルコトヲ掌ラシム
第二十一條 鎭守府ニ兵事官ヲ置キ參謀長ノ命ヲ受ケ兵籍ヲ主管シ徵兵募兵及艦船團其ノ他各部ノ下士卒定員ノ補缺竝豫備役兵後備役兵ノ召集簡閱㸃呼ニ關スルコトヲ掌ラシム
第二十二條 鎭守府ニ艦政部、機關部、醫務部、經理部及司法部ヲ置ク
第二十三條 艦政部ニ於テハ兵器、艦營需品及艦船ノ船體、機關ニ關スルコトヲ掌ル
第二十四條 機關部ニ於テハ艦船ノ機關ノ使用保存ニ關スルコト及機關官以下ノ勤務ニ關スルコトヲ掌ル
第二十五條 醫務部ニ於テハ醫務衞生ニ關スルコトヲ掌ル
第二十六條 經理部ニ於テハ會計經理、造兵造船ノ材料物件ニ非ラサル通常物品ノ購買供給、鎭守府所管一般及其ノ所屬艦船團竝軍港境域內ニ在ル其ノ他ノ諸官衙ノ會計事務ノ監督、管區內ニ在ル艦船團其ノ他各部諸官衙ノ金櫃物件及帳簿ノ監査ヲ掌リ第一課第二課ヲ置キ其ノ事務ヲ分掌セシム
經理部ニ衣糧科ヲ置キ衣服糧食ノ準備保存供給ニ關スルコトヲ掌ラシム
經理部ニ建築科ヲ置キ官有財產建築及土木ニ關スルコトヲ掌ラシム
第二十七條 司法部ニ於テハ軍事司法、懲罰及監獄ニ關スルコトヲ掌ル
第二十八條 艦政部、機關部、醫務部、經理部及司法部ニ左ノ職員ヲ置ク
第二十九條 各部長ハ司令長官ノ命ヲ承ケ其ノ部ノ事務ヲ掌理ス
經理部長ハ會計事務ノ監督及金櫃物件帳簿ノ監査ニ就テハ海軍大臣ニ隸ス
第三十一條 經理部課長ハ部長ノ命ヲ承ケ各其ノ課ノ事務ヲ掌ル
第三十二條 經理部科長ハ部長ノ命ヲ承ケ各其ノ科ノ事務ヲ掌ル
第三十三條 鎭守府ニ臨時艤裝委員ヲ置キ艤裝ニ關スル事務ニ服セシムルコトヲ得
第三十四條 前諸條ニ揭クル職員ノ外海軍兵曹長同相當官竝准士官下士卒及書記錄事技手ヲ置キ各部ニ分屬シ各上官ノ命ヲ承ケ服務セシム