第二條 鎭守府ハ出師ノ準備兵備品ノ供給軍港要港ノ防禦海軍區ノ警備軍艦ノ製造修理兵員ノ徵募訓練ヲ掌ル所トス
第三條 鎭守府ニ司令長官一人ヲ置キ海軍將官ヲ以テ之ニ補シ
天皇ニ直隸シ所屬ノ軍艦團隊ヲ統率シ軍事ヲ統理シ又海軍大臣ノ命ヲ受ケ所管ノ軍政ヲ總理ス
第五條 司令長官ハ軍港內ニ在ル麾下ノ一艦ニ其旗章ヲ揭揚ス
第六條 司令長官ハ麾下ノ艦船ヲ所管海軍區及隣區內ニ派遣スルコトヲ得又練習ノ爲メ五日以內ノ日數ヲ以テ軍隊ヲ陸路二十里以內ニ派遣スルコトヲ得
第七條 司令長官ハ軍港內一般ニ關スルコトニ於テハ其軍港內ニアル他管ノ軍艦ヲ指揮スヘシ又戰時事變ニ際シテハ軍港內ニアル他管ノ軍艦兵員ヲ以テ軍港ノ守備ニ供スルコトヲ得
第八條 司令長官ハ疾疫及其他緊急ノ場合ニ方リ一時麾下ノ兵員ヲ移轉セシムルヲ必要トスルトキ之ヲ處分シテ後海軍大臣及軍令部長ニ報吿スヘシ
第九條 司令長官ハ麾下ノ職員事故アルトキハ他ノ職員ヲシテ代理セシムルコトヲ得但艦船隊ノ職員ハ此限ニアラス
第十條 司令長官ハ麾下ノ准士官以下ヲ麾下艦團隊其他各部ニ轉乘若クハ轉勤セシムルコトヲ得
第十一條 司令長官ハ部下ノ運送船曳船小蒸氣船等ニ乘員ヲ要スルトキハ麾下人員ニ臨時乘組ヲ命スルコトヲ得
第十三條 參謀長ハ司令長官ノ命ヲ受ケ鎭守府一般ノ事ニ參シ特ニ出師ノ準備軍港要港ノ防禦海軍區ノ警備望樓檢閱演習ニ關スル事ヲ掌ル
第十五條 祕書ハ司令長官ノ命ヲ受ケ機密事務ヲ掌リ又參謀長所管ノ事務ヲ助ク
第十六條 機關長ハ司令長官ノ命ヲ受ケ鎭守府所管艦團隊ノ機關ニ關スル事ヲ掌ル
第十七條 軍醫長ハ司令長官ノ命ヲ受ケ鎭守府及所管艦團隊ノ醫務衞生ニ關スル事ヲ掌ル
第十八條 主理ハ司令長官ノ命ヲ受ケ法律ニ關スル事ヲ掌ル
第十九條 鎭守府ニ豫備艦部造船部測器庫武庫水雷庫兵器工場病院及監獄ヲ置ク
第二十條 豫備艦部ハ鎭守府豫備艦ヲ統轄シ其保安及就役ノ準備ヲ掌ル
第二十一條 造船部ハ艦船及其屬具ノ製造修理及艤裝ヲ掌ル造船科造機科ヲ置キ其事務ヲ分擔セシム
第二十二條 測器庫ハ測器及航海ニ關スル圖書ノ準備供給ヲ掌リ及氣象ノ觀測ヲ爲ス
第二十六條 病院ハ治療及治療品ノ調辨貯藏供給看護手看病夫ノ敎育ヲ掌ル
第二十七條 第十九條ニ揭クル部庫工場及病院ニ左ノ職員ヲ置ク
各庫及兵器工場
技士但測器庫水雷庫竝吳及佐世保鎭守府兵器工場ニハ之ヲ置カス
部長主管及病院長ハ司令長官ノ命ヲ受ケ其他ノ職員ハ部長主管若クハ病院長ノ命ヲ受ケテ事務ニ服ス
第二十八條 造船部ニ造船材料倉庫主管ヲ置キ部長ノ命ヲ受ケ造船材料ノ購買賣却貯藏出納ノ事ヲ掌ラシム
第二十九條 鎭守府ニ知港事副知港事ヲ置ク知港事ハ司令長官ノ命ヲ受ケ所屬諸船ヲ統轄シ港則ヲ維持シ海運海標及救難防火等ノ事ヲ掌ル副知港事ハ知港事ヲ助ク但吳及佐世保鎭守府ニハ副知港事ヲ置カス
第三十條 鎭守府ニ臨時艤裝委員ヲ置キ海軍上長官以下若干名ヲ以テ之ニ充ツルコトアルヘシ
第三十一條 本條例ニ揭クル外屬員トシテ判任官ヲ置ク
第三十二條 各鎭守府職員ノ官等及定員ハ別ニ定ムルモノヽ外左ノ表ニ依ル