第一條 鎭守府ニ參謀部軍醫部主計部造船部兵器部建築部軍法會議監獄署ヲ置ク
第二條 鎭守府管內ニ屯營水雷營病院武庫倉庫ヲ配置ス
第四條 司令長官ハ其所屬ノ艦船軍人軍屬ヲ管轄シ軍港要港ノ防禦管內ノ警保艦船ノ製造修理兵器軍需品ノ貯藏配賦及兵員ノ召募徵集訓練ヲ掌ル
第五條 司令長官ハ其港內ニ旗艦ヲ置キ在港ノ艦船ヲ指揮ス
第六條 司令長官ハ平時ニ於テ麾下艦船ノ管外航海及例外行軍例外演習等ノ軍令ニ關スルモノハ海軍大臣ニ申報シ又軍人軍屬ノ進退黜陟轉換撰任及會計給與等ニ關スルモノハ海軍大臣ノ區處ヲ承クヘシ
第七條 司令長官ハ其管內ニ疑ハシキ艦船アルトキハ其搜索警戒ノ爲メ麾下ノ艦船ヲ管內ニ巡航セシムルコトヲ得但定例巡航外ニ涉ルトキハ海軍大臣ノ區處ヲ承クヘシ
第八條 司令長官ハ他管ノ艦隊又ハ艦船其港內ニ入港スルトキハ港內一般ニ係ル事項ニ就キ之ヲ指揮スヘシ
第九條 司令長官ハ管內騷擾ノ警アルトキハ先ツ情狀ヲ海軍大臣ニ申報シテ其區處ヲ承クヘシ但事火急ニシテ兵力ヲ要シ地方長官ヨリ出兵ヲ要求スルトキハ之ニ應シ狀ヲ具シテ海軍大臣ニ急報シ仍ホ比隣鎭守府ニ通報スヘシ
第十條 司令長官ハ戰時若クハ事變ニ際シテハ其港內ニアル他管ノ艦船其他軍人ヲ以テ其港ノ守衞ニ供スルコトヲ得
第十一條 軍政ニ關スル重要ノ事項ハ司令長官臨時軍政會議ヲ開キ其議長ト爲リ之ヲ審議決定スヘシ
第十二條 軍政會議ハ軍港司令官造船部長兵器部長建築部長主計部長ヲ以テ組織ス但時宜ニ依リ參謀長又ハ軍醫部長ヲ列セシム
第十三條 參謀長ハ司令長官ノ職務ヲ輔佐シ專ラ其機務ニ參シ軍醫部主計部其他各官廨ノ職員ヲ監視ス
第十四條 參謀長ハ司令長官不在中特ニ委任セラレタル事件ハ司令長官ノ名ヲ以テ命令ヲ出スコトヲ得
第十五條 參謀長ハ鎭守府所屬ノ病院監獄等ノ紀律ヲ監督ス
第十七條 參謀長ハ前諸條ニ揭クル職務ノ外左ノ事務ヲ掌ル
一、 軍港ノ守衞警保及造船部兵噐部建築部ノ警察幷門衞ニ關スル事項
第十八條 參謀ハ參謀長ノ命ヲ承ケ參謀部ノ事務ヲ分掌ス
第十九條 司令長官傳令使ハ差使及命令傳達ヲ掌リ又參謀部ノ事務ヲ分掌ス
第二十條 司令長官秘書ハ機密文書ヲ掌リ府內ノ庶務ヲ整理シ官印ヲ監守ス
第二十一條 司令長官秘書補ハ秘書ノ命ヲ承ケ文書往復等ノ事務ニ服ス
第二十二條 文庫主管ハ參謀長ノ命ヲ承ケ圖書ノ保存出納ヲ掌ル
第二十三條 測噐試驗所主管ハ參謀長ノ命ヲ承ケ測噐ノ試驗ヲ掌ル
第二十五條 軍醫部長ハ司令長官ノ命ヲ承ケ主管ノ事務ヲ總理ス
第二十六條 軍醫部長ハ鎭守府一般ノ醫務衞生及軍醫官以下ヲ監督ス
第二十七條 部員ハ各所ニ派出シ治療及調劑ノ事ヲ掌ル
第二十八條 病院長ハ軍醫部長ノ命ヲ承ケ院內ノ紀律及患者ノ治療ヲ掌ル
第二十九條 病院長ノ下ニ軍醫少監以下若干人ヲ置キ治療及調劑ノ事ヲ掌ラシム
第三十條 醫務衞生ニ關スル重要ノ事項ハ軍醫部長司令長官ノ命ヲ承ケ臨時衞生會議ヲ開キ其議長ト爲リ之ヲ審議決定スヘシ
第三十一條 衞生會議ハ病院長艦船營軍醫長及部員若干名ヲ以テ組織ス
第三十二條 主計部ニ計算課人員課材料課衣糧課給與課ヲ置キ其事務ヲ分掌セシム
第三十四條 計算課ハ其課員ヲ造船部兵器部建築部ニ派出シ左ノ事務ヲ掌理セシム
第三十五條 計算課ハ其課員ヲ病院及監獄署ニ派出シ左ノ事務ヲ掌理セシム
第四十條 主計部長ハ司令長官ノ命ヲ承ケ主管ノ事務ヲ總理ス
第四十一條 主計部長ハ鎭守府一般ノ主計官以下ヲ監督ス
第四十四條 主計部ハ中央倉庫ヲ所轄シ各部各官廨艦船營一般ノ需用ニ供スル爲メ普通ノ材料物品ヲ貯藏配付セシム
第四十五條 中央倉庫主管ハ主計部長ノ命ヲ承ケ倉庫ヲ管守シ材料物品ノ保存出納ヲ掌ル
第五十條 造船部兵噐部建築部ノ長ハ司令長官ノ命ヲ承ケ主管ノ事務ヲ總理ス
第五十一條 造船部ノ各科長ハ部長ノ命ヲ承ケ科務ヲ整理ス
第五十二條 造船部各科及兵器部建築部ノ主幹ハ部長ノ命ヲ承ケ各分掌ノ工業ヲ擔任ス
第五十三條 武庫水雷庫ノ主管ハ兵器部長ノ命ヲ承ケ兵器水雷及其屬具ノ保存出納ヲ掌ル
第五十四條 監獄署長ハ司令長官ノ命ヲ承ケ主管ノ事務ヲ總理ス
第五十五條 警査長ハ署長ノ命ヲ承ケ警査ヲ指揮シ監獄ノ巡視警戒ヲ掌ル
第五十六條 各軍港ニ軍港司令部ヲ置キ其部下ニ豫備艦水雷部航海部ヲ置キ其職員ヲ定ムルコト左ノ如シ
第五十七條 軍港司令官ハ艦船營兵員及海軍所屬ノ砲臺ヲ指揮シ軍港ノ守備ヲ掌ル
第五十八條 軍港司令官ハ軍紀風紀ヲ維持シ所屬軍人軍屬ノ訓練敎育ヲ監督ス
第五十九條 軍港司令官ハ鎭守府管轄ノ左ノ艦船ヲ指揮ス
第六十條 軍港司令官ハ其港內ニ在ル艦船ニ港內規則ヲ遵守セシムヘシ
第六十一條 軍港司令官ハ諸般ノ法律命令ヲ麾下ニ布達シ又麾下艦船營長ノ上申及報吿ヲ㸃檢シ鎭守府司令長官ニ進達ス
第六十二條 軍港司令官ハ麾下ノ艦船ヲ㸃檢シ其現狀性質並ニ乘員ノ景況ヲ詳知シ又常ニ艦船ヲ整頓準備シ若シ役務ニ適セサルコトヲ發見スルトキハ速ニ鎭守府司令長官ニ報吿スヘシ
第六十三條 軍港司令官ハ麾下ノ艦船ヲ各所ニ配置スルトキハ發航ノ前歸著ノ後及艦船新ニ麾下ニ屬スルトキハ之ヲ㸃檢シ其詳細ヲ鎭守府司令長官ニ報吿スヘシ
第六十四條 軍港司令官自ラ㸃檢ヲ行フ能ハサルトキハ豫備艦總理ヲシテ之ヲ行ハシムルコトヲ得
第六十五條 軍港司令官ハ麾下將校以下服務ノ程度ヲ覈察シ其黜陟轉換等ノ事ニ就テ意見アルトキハ之ヲ鎭守府司令長官ニ申吿スヘシ
第六十六條 軍港副官ハ司令官ノ命ヲ承ケ軍港司令部ノ庶務ヲ整理シ文書ノ往復受附等ノ事ヲ掌ル
第六十七條 軍港司令官傳令使ハ差使及命令傳達ヲ掌リ又軍港司令部ノ事務ヲ分掌ス
第六十八條 豫備艦總理ハ軍港司令官ノ命ヲ承ケ豫備艦船ヲ管轄シ其守衞保存及就任準備ノ事ヲ總理ス
第六十九條 豫備艦副總理ハ總理ヲ輔佐シ其主務ヲ整理ス
第七十條 豫備艦機關長ハ豫備艦ノ機關ニ係ル事ヲ整理シ機關官以下ヲ監督ス
第七十一條 豫備艦船具庫主管ハ總理ノ命ヲ承ケ豫備艦ニ屬スル噐具物品ノ準備保存ヲ掌ル
第七十二條 水雷司令ハ軍港司令官ノ命ヲ承ケ攻擊水雷及防禦水雷ニ關スル事項幷ニ水雷艇隊及布設水雷ノ指揮ヲ掌ル
第七十三條 水雷副司令ハ司令ヲ輔佐シ其主務ヲ整理ス
第七十五條 航海部長ハ軍港司令官ノ命ヲ承ケ主管ノ事務ヲ總理ス
第七十七條 倉庫主管ハ部長ノ命ヲ承ケ艦船附屬具等ノ保存出納ヲ掌ル
第七十八條 第三條第五十六條ニ揭クル職員ノ外屬員トシテ判任官若干人ヲ置ク