第一條神奈川縣、兵庫縣、長崎縣及福岡縣ニハ地方官官制第十六條ニ揭クル部署ノ外港務部ヲ置キ海港檢疫所ヲ附屬セシム長崎縣港務部ニハ海港檢疫所ノ外海港檢疫支所ヲ附屬セシム

第二條港務部ヲ置キタル縣ニハ左ノ職員ヲ置ク港務長港務官港務醫官屬港吏港務醫官補港務調劑手

第三條港務長ハ一人、港務官ハ二人及港務醫官ハ一人奏任トス屬、港吏、港務醫官補及港務調劑手ハ判任トシ通シテ七十四人ヲ以テ定員トシ其ノ各縣ノ定員ハ內務大臣之ヲ定メ其ノ各官ノ定員ハ內務大臣ノ認可ヲ經テ知事之ヲ定ム

第四條港務部ニ三課ヲ置キ事務ヲ分掌セシムルコト左ノ如シ海務課一開港港則ニ關スル事項二開港港則施行區域內ニ於ケル行政警察及衞生ニ關スル事項檢疫課一海港檢疫ニ關スル事項庶務課一庶務ニ關スル事項各課ニ課長ヲ置ク課長ハ上官ノ指揮ヲ承ケ其ノ課務ヲ處理ス

第五條港務長ハ港務部長ト爲リ知事ノ命ヲ承ケ部下ノ官吏ヲ監督シ所部ノ事務ヲ掌理ス港務長ハ港長ノ事務ヲ行ヒ所部ノ事務ニ關シテハ水上警察署長ヲ指揮監督ス

第六條港務部長事故アルトキハ知事ニ於テ縣官吏ノ一人ヲシテ其ノ事務ヲ代理セシム

第七條港務官ハ上官ノ指揮ヲ承ケ其ノ事務ヲ分掌ス港務官ハ知事ノ命ヲ承ケ海務課長又ハ檢疫課長ト爲ル

第八條港務醫官ハ上官ノ指揮ヲ承ケ醫務ニ從事ス

第九條屬ハ上官ノ指揮ヲ承ケ庶務ニ從事ス屬ハ知事ノ命ヲ承ケ庶務課長ト爲ル

第十條港吏ハ上官ノ命ヲ承ケ事務ヲ分掌ス

第十一條港務醫官補ハ上官ノ指揮ヲ承ケ醫務ニ從事ス

第十二條港務調劑手ハ上官ノ指揮ヲ承ケ調劑ニ從事ス

第十三條港務部ヲ置キタル縣ニ於テハ知事ハ臨時必要アリト認ムルトキハ檢疫又ハ醫務ニ從事セシムル爲海港檢疫費豫算定額內ニ於テ港務部ニ檢疫員又ハ檢疫醫員ヲ置クコトヲ得檢疫員及檢疫醫員ハ判任官ノ待遇トス